|
|
Predikce proteinových domén
Valenta, Martin ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Práce představuje oblast proteinů a jejich domén. Stručně popisuje metody získání proteinové struktury na různých úrovních hierarchie. Pozornost je dále věnována existujícím nástrojům pro predikci proteinových domén a databázím sdružujícím informace o doménách. Dále jsou představeni vybraní zástupci metod predikce pracující jak s informacemi o vnitřní struktuře molekuly, tak se sekvencí aminokyselin. V příslušné kapitole je nastíněn realizovaný postup predikce hranic domén z primární struktury proteinu, využívající neuronovou síť. Zbývající část práce se zabývá testováním vytvořené implementace metodou křížové validace a možnostmi jejího dalšího rozvoje.
|
|
|
The influence of non-domain regions' composition on the activity of multi-domain protein kinases
Hamalčík, Jan ; Vondrášek, Jiří (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
Kinásy jsou jedny z nejvíce studovaných proteinů, neboť hrají důleži- tou roli v mnohých buněčných procesech. Aktuální výzkum prokazuje, že jejich aktivita není závislá pouze na komposici domén, nýbrž taktéž na ne- doménových regionech. Tato bakalářská práce si dala za cíl obecně porozumět vlivu složení linkerů na funkci vícedoménových protein kinás. Dvoudoménové lidské protein kinásy s jedinou kinásovou doménou byly zklastrovány dle zprůměrovaných fysikálně chemických vlastností mezidoménových oblastí, načež se zkoumala unikátnost Gene Ontology a Enzyme Commission pojmů v rámci nalezených klastrů složených z proteinů různých architektur. Ovšem vzhledem k víceru nedostatkům, žádný takový vliv nebyl pozorován. 1
|
|
|
Predikce proteinových domén
Valenta, Martin ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Práce představuje oblast proteinů a jejich domén. Stručně popisuje metody získání proteinové struktury na různých úrovních hierarchie. Pozornost je dále věnována existujícím nástrojům pro predikci proteinových domén a databázím sdružujícím informace o doménách. Dále jsou představeni vybraní zástupci metod predikce pracující jak s informacemi o vnitřní struktuře molekuly, tak se sekvencí aminokyselin. V příslušné kapitole je nastíněn realizovaný postup predikce hranic domén z primární struktury proteinu, využívající neuronovou síť. Zbývající část práce se zabývá testováním vytvořené implementace metodou křížové validace a možnostmi jejího dalšího rozvoje.
|
host ::
RSS.